藏獒的皮肤由表皮、真皮和皮下组织构成。
藏獒身上的被毛除了保证适宜的体温外，更主要的还有其对外的防御功能。它的真皮含有血管、皮肤腺体和毛囊，它的毛便从这里穿出表皮生长出来。它的毛囊非常多，这有助于更好地结合2个皮层。
藏獒和其他犬类不一样，它是极特殊的古老犬类品种，披着一张厚厚的毛皮。每根毛都从毛囊中长出，又分绒毛和针毛。毛从有几根毛发的毛嚢复合体中生长出来，其包括1根主毛，也叫针毛，或称护毛。它是最粗和最长的毛。还有几根辅毛组成柔软的内层毛，也就是所说绒毛、细毛。大多数毛囊都有肌肉牵附，因为这些肌肉的牵附角是锐角，易拉动毛发，因此，肌肉收缩时藏獒”毛发耸立”，看起来像雄狮一样威猛。
皮脂腺，它与毛嚢相连，使其皮毛具有油性并含有维生素C等成分。皮脂腺会分泌出皮脂，均匀地镀在毛皮的表面，防止毛皮过于潮湿或干燥，毛发油亮，并且将体外温度隔离开来，保持机体的恒温，很少因外界温度而引起变化。
藏獒的毛发非常敏感，毛囊很深，有很多的神经和血液供给，从而保证毛发有足够的敏感性。特别是睫毛、耳毛、鼻子更特殊。
每年晚春季节冬毛脱落，逐渐地更换为夏毛，晚秋初冬季节更换夏毛，逐渐地更换为冬毛，每年换毛2次。分为生长初期、生长中期和生长终期。