云石基因(MERLE)在前文已经介绍过。我们知道，人的基因分为X，x，Y，y，大写的XY被我们称为显性基因，小写的则称为隐性基因。在遗传中，显性基因会占到主导地位，例如单双眼皮的遗传。而苏格兰牧羊犬的云石基因也分为M，m(分别为显性和隐性)。
首先来看显性基因的云石和隐性基因的非云石的繁殖公式。(M+m)X(m+m)=(M+m)+(M+m)+(m+m)+(m+m)，这样可以有50%的几率得到正常的云石。同理，如果用DM用于繁殖，与隐性的(m+m)相配，那得到云石的几率将是100%。
这里要做特别说明的是，MERLE基因是一把双刃剑，在掌握好了的情况下，会得到非常漂亮的大理石色。但如果是没有专业知识的随意性繁殖，就会使苏格兰牧羊犬出现很多遗传性疾病。如先天性失明，眼球发育不良等。更为严重的甚至会付出生命的代价，由于黑色素的严重缺失而造成胎死腹中的悲惨结局。
现在的宠物市场云石的价格被抬得非常之高，其中一个原因就是它们在正常繁殖的过程中属于稀有毛色。而一些不尊重生命而单纯追求利益的人就开始故意繁殖出DM，使这种拥有双倍云石基因的苏格兰牧羊犬继续繁殖，从而提高云石的出生率。虽然毛色得到了保证，但是这种基因的犬只存活率很低，即使得以存活也不会有健康的体魄。